沙眼衣原体是比较小的一种病原微生物，会黏附在精子头部，影响精子和卵子结合受精，无法受精自然是不能怀孕的。

一般来说如果症状不严重，衣原体的数量不多，只要精液检查正常并不影响怀孕，但会通过性生活传染给女方，那就影响怀孕了。

女性沙眼衣原体感染之后，先在宫颈处捣乱破坏，然后会逆行至宫腔、输卵管，造成子宫内膜和输卵管发炎。

子宫内膜受到沙眼衣原体感染之后，出现炎症或长内膜息肉，甚至引起输卵管粘连等等问题，造成精子和卵子无法相见，导致怀孕困难。

女性出现宫腔内感染沙眼衣原体后，衣原体就赖在宫腔不走了，即使怀孕了，由于衣原体的存在也会影响胚胎的发育，造成胎儿畸形或者**。

可能会导致早产、胎膜早破、死胎、胎儿宫内感染以及胎儿宫内发育迟缓。

此外分娩期间，新生儿经过母亲产道时也可被感染，导致新生儿患衣原体结膜炎和肺炎。

沙眼衣原体一旦有感染，首先是要进行有效的治疗，必须得治好了之后再生育，这才会比较安全。